Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms