Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPDYE2Q495Y8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SPDYE2Q495Y8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPDYE2Q495Y8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms