Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC36A3Q495N2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC36A3Q495N2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms