Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms