Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRIM71Q2Q1W2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms