Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms