Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SWI5Q1ZZU3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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