Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KNOP1Q1ED39 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNOP1Q1ED39 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNOP1Q1ED39 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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