Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GEN1Q17RS7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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