Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC142Q17RM4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
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