Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMPG1Q17R60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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