Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIST3H3Q16695 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST3H3Q16695 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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