Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF9Q16594 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms