Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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TNXAQ16473 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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TNXAQ16473 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TNXAQ16473 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TNXAQ16473 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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TNXAQ16473 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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TNXAQ16473 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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TNXAQ16473 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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TNXAQ16473 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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TNXAQ16473 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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TNXAQ16473 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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