Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC9A3R2Q15599 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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