Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDCD1Q15116 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDCD1Q15116 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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