Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIXQ14938 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NFIXQ14938 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIXQ14938 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
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