Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM29Q14134 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM29Q14134 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM29Q14134 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms