Protein–RNA interactions for Protein: Q13887

KLF5, Krueppel-like factor 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF5Q13887 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF5Q13887 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF5Q13887 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms