Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC2Q13868 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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