Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP1Q13829 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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TNFAIP1Q13829 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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TNFAIP1Q13829 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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TNFAIP1Q13829 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP1Q13829 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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