Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.559e-9■■■■□ 21.9
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TRA2AQ13595 CACYBP-208ENST00000483307 688 ntTSL 219.47■□□□□ 0.719e-7■■■■□ 21.9
TRA2AQ13595 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.619e-7■■■■□ 21.9
TRA2AQ13595 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 21.9
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TRA2AQ13595 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.099e-7■■■■□ 21.9
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TRA2AQ13595 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.429e-7■■■■□ 21.9
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TRA2AQ13595 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.59e-7■■■■□ 21.9
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TRA2AQ13595 TTC3-218ENST00000484047 1945 ntTSL 28.84□□□□□ -12e-10■■■■□ 21.7
TRA2AQ13595 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.576e-7■■■■□ 21.6
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TRA2AQ13595 PRRC2C-207ENST00000470689 224 ntTSL 22.67□□□□□ -1.982e-6■■■■□ 21.6
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