Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQSTM1Q13501 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQSTM1Q13501 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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