Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK7Q13308 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK7Q13308 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTK7Q13308 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms