Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPTFQ12830 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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