Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD47Q08722 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD47Q08722 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD47Q08722 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD47Q08722 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD47Q08722 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD47Q08722 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD47Q08722 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD47Q08722 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD47Q08722 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD47Q08722 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD47Q08722 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD47Q08722 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD47Q08722 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD47Q08722 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD47Q08722 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD47Q08722 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD47Q08722 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD47Q08722 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD47Q08722 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD47Q08722 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD47Q08722 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD47Q08722 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD47Q08722 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD47Q08722 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD47Q08722 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD47Q08722 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms