Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBQ06643 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBQ06643 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBQ06643 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBQ06643 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBQ06643 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBQ06643 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBQ06643 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBQ06643 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBQ06643 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBQ06643 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBQ06643 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBQ06643 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBQ06643 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBQ06643 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBQ06643 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBQ06643 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBQ06643 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBQ06643 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBQ06643 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBQ06643 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBQ06643 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBQ06643 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LTBQ06643 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LTBQ06643 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LTBQ06643 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
LTBQ06643 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBQ06643 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LTBQ06643 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms