Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRSF11Q05519 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRSF11Q05519 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms