Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OCA2Q04671 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OCA2Q04671 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms