Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBE1Q04446 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms