Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP2Q03169 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms