Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRF8Q02556 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF8Q02556 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF8Q02556 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms