Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSG9Q00887 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSG9Q00887 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms