Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSF1Q00613 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms