Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPCAP84074 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPCAP84074 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPCAP84074 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPCAP84074 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPCAP84074 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPCAP84074 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPCAP84074 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPCAP84074 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPCAP84074 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPCAP84074 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPCAP84074 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAP84074 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAP84074 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAP84074 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAP84074 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAP84074 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAP84074 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAP84074 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAP84074 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAP84074 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAP84074 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAP84074 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPCAP84074 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAP84074 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAP84074 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAP84074 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAP84074 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAP84074 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAP84074 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPCAP84074 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPCAP84074 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms