Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms