Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITX1P78337 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITX1P78337 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITX1P78337 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITX1P78337 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITX1P78337 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PITX1P78337 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITX1P78337 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITX1P78337 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITX1P78337 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITX1P78337 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITX1P78337 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX1P78337 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX1P78337 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX1P78337 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX1P78337 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX1P78337 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX1P78337 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITX1P78337 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITX1P78337 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITX1P78337 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITX1P78337 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX1P78337 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITX1P78337 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITX1P78337 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITX1P78337 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITX1P78337 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITX1P78337 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITX1P78337 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITX1P78337 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITX1P78337 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITX1P78337 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITX1P78337 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX1P78337 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX1P78337 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX1P78337 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PITX1P78337 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX1P78337 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX1P78337 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX1P78337 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX1P78337 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms