Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC5P78333 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC5P78333 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC5P78333 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC5P78333 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC5P78333 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC5P78333 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC5P78333 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC5P78333 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC5P78333 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC5P78333 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC5P78333 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC5P78333 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC5P78333 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC5P78333 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC5P78333 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC5P78333 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC5P78333 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC5P78333 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC5P78333 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC5P78333 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC5P78333 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC5P78333 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC5P78333 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC5P78333 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC5P78333 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC5P78333 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC5P78333 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC5P78333 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC5P78333 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC5P78333 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC5P78333 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC5P78333 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC5P78333 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC5P78333 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC5P78333 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC5P78333 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC5P78333 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC5P78333 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC5P78333 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC5P78333 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC5P78333 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC5P78333 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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