Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRA2BP62995 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRA2BP62995 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRA2BP62995 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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