Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL7AP62424 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL7AP62424 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms