Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPD3P62318 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms