Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms