Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPS1P60891 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms