Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTXN1P60606 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN1P60606 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms