Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVFRD-1P60508 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFRD-1P60508 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms