Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEFA3P59666 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA3P59666 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms