Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSX2P58304 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSX2P58304 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSX2P58304 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSX2P58304 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSX2P58304 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSX2P58304 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSX2P58304 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSX2P58304 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSX2P58304 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSX2P58304 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSX2P58304 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSX2P58304 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSX2P58304 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSX2P58304 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VSX2P58304 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSX2P58304 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSX2P58304 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSX2P58304 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSX2P58304 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms