Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX16P57768 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX16P57768 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX16P57768 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX16P57768 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX16P57768 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX16P57768 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX16P57768 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX16P57768 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX16P57768 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX16P57768 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX16P57768 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX16P57768 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX16P57768 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX16P57768 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX16P57768 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX16P57768 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX16P57768 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX16P57768 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX16P57768 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX16P57768 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX16P57768 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX16P57768 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX16P57768 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX16P57768 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX16P57768 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX16P57768 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX16P57768 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX16P57768 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX16P57768 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX16P57768 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX16P57768 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX16P57768 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX16P57768 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX16P57768 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX16P57768 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX16P57768 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX16P57768 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX16P57768 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms