Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH8P55286 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH8P55286 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH8P55286 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH8P55286 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH8P55286 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH8P55286 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH8P55286 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH8P55286 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH8P55286 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH8P55286 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH8P55286 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH8P55286 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH8P55286 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH8P55286 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH8P55286 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH8P55286 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH8P55286 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH8P55286 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH8P55286 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH8P55286 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH8P55286 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH8P55286 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH8P55286 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH8P55286 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH8P55286 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH8P55286 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH8P55286 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH8P55286 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH8P55286 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH8P55286 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH8P55286 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH8P55286 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH8P55286 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH8P55286 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH8P55286 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH8P55286 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH8P55286 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH8P55286 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH8P55286 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH8P55286 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH8P55286 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH8P55286 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH8P55286 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH8P55286 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH8P55286 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH8P55286 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH8P55286 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH8P55286 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH8P55286 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms