Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
AFDNP55196 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFDNP55196 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFDNP55196 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFDNP55196 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFDNP55196 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFDNP55196 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFDNP55196 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AFDNP55196 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AFDNP55196 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
AFDNP55196 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
AFDNP55196 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFDNP55196 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFDNP55196 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFDNP55196 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFDNP55196 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFDNP55196 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFDNP55196 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AFDNP55196 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
AFDNP55196 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
AFDNP55196 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AFDNP55196 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AFDNP55196 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AFDNP55196 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
AFDNP55196 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AFDNP55196 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AFDNP55196 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AFDNP55196 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AFDNP55196 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AFDNP55196 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AFDNP55196 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AFDNP55196 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AFDNP55196 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AFDNP55196 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
AFDNP55196 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
AFDNP55196 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
AFDNP55196 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
AFDNP55196 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
AFDNP55196 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
AFDNP55196 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AFDNP55196 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AFDNP55196 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AFDNP55196 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
AFDNP55196 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AFDNP55196 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AFDNP55196 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AFDNP55196 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
AFDNP55196 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AFDNP55196 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AFDNP55196 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AFDNP55196 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AFDNP55196 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AFDNP55196 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AFDNP55196 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AFDNP55196 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AFDNP55196 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AFDNP55196 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFDNP55196 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFDNP55196 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFDNP55196 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFDNP55196 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFDNP55196 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AFDNP55196 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
AFDNP55196 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AFDNP55196 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AFDNP55196 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AFDNP55196 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AFDNP55196 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
AFDNP55196 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AFDNP55196 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AFDNP55196 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AFDNP55196 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms