Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCKAP1LP55160 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms